Принцип определения первичной структуры относительно крупных (более тысячи пар нуклеотидов) фрагментов ДНК, заключается в ферментативном укорачивании секвенируемого фрагмента с одного конца с получением дискретного набора субфрагментов (т.е. набора однонаправленных делеций), различающихся по длине на 300-500 пар нуклеотидов; метод К. предложен У.Барнесом и М.Бивэном в 1983.